53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1566 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1566  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  280  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0512  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 129 aa  150  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00633837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2288  response regulator receiver protein  53.6 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3357  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1231  response regulator  48.84 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1147  response regulator receiver protein  52.8 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3115  response regulator receiver protein  52.8 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1747  response regulator receiver domain-containing protein  48 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.244381 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3999  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 567 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 		 378 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05894  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 846 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 212 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  27.88 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4608  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.360266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0374  response regulator receiver protein  27.38 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 753 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  28.74 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  26.51 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  31.75 
 
 		 407 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  31 
 
 		 388 aa  42.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2451  response regulator  29.91 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1102  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.863514 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0399  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.99 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1940  response regulator  27.48 
 
 		 397 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.15 
 
 		 461 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  27.55 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2042  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0458  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 384 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0437  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 490 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3005  response regulator receiver domain-containing protein  28 
 
 		 212 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0327  response regulator receiver domain-containing protein  25.3 
 
 		 142 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  35.48 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1360  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.27 
 
 		 525 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5036  response regulator receiver  30 
 
 		 294 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.118598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 447 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4156  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 443 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.41 
 
 		 394 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0109  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.24 
 
 		 348 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  37.7 
 
 		 732 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2403  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 467 aa  40.8  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  30.23 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 379 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1271 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5482  response regulator  29.85 
 
 		 297 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.420057  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2327  chemotaxis-specific methylesterase  33.82 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  30.59 
 
 		 388 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0803  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.76 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  32.79 
 
 		 353 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  26.36 
 
 		 237 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 121 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2653  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.11 
 
 		 482 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>