More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1102 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1102  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.863514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 769 aa  90.1  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 789 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 753 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 931 aa  78.2  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 		 637 aa  77.8  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  35.59 
 
 		 474 aa  77.4  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 401 aa  77  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 603 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 768 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 500 aa  74.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 603 aa  73.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 653 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 		 849 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 593 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 896 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 660 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 440 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 		 669 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  31.9 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 1513 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 766 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 984 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 530 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 1325 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 		 400 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 1078 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 909 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 608 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 524 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1301 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 		 559 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 781 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 813 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2442  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 		 511 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 980 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 862 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 886 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 1276 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  29.75 
 
 		 812 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 1439 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  31.37 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 1032 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  30.25 
 
 		 461 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 656 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 268 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 		 1253 aa  63.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  28.95 
 
 		 402 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  26.27 
 
 		 1265 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 657 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  37.08 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 771 aa  62  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 737 aa  62  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 544 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1039 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1045  response regulator receiver protein  39.78 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  34.92 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  33.59 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 347 aa  60.8  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  36.51 
 
 		 228 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.66 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4279  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 232 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 2072 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1750  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33 
 
 		 466 aa  60.5  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  32.56 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 		 287 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  28.1 
 
 		 479 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2531  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  31.2 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.92 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  37.62 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  30.48 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 764 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 596 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2037  response regulator receiver domain-containing protein  26.72 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119709  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 783 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.91 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.66 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 901 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  35.51 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05830  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.3 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.388223  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 765 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 1425 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  31.63 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4252  two component transcriptional regulator  27.18 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.542635  unclonable  0.0000000142406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>