More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2388 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  100 
 
 		 127 aa  259  8e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.17 
 
 		 769 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.24 
 
 		 660 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  49.19 
 
 		 909 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.5 
 
 		 771 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 886 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.82 
 
 		 603 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.07 
 
 		 608 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 1301 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 637 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  47.58 
 
 		 400 aa  124  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 931 aa  124  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  47.11 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.99 
 
 		 657 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.07 
 
 		 1426 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 511 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 896 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.74 
 
 		 862 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  47.54 
 
 		 1265 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 		 653 aa  119  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  48.28 
 
 		 1113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 1039 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 544 aa  118  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  50.42 
 
 		 268 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 603 aa  117  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.09 
 
 		 530 aa  117  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 		 1439 aa  116  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 783 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 1253 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 766 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 		 873 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  47.54 
 
 		 812 aa  114  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 1513 aa  114  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  46.28 
 
 		 401 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 1078 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 593 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 644 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 753 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  43.8 
 
 		 849 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 789 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 813 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 		 763 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  41.32 
 
 		 376 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  46.22 
 
 		 837 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  44.92 
 
 		 402 aa  110  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 524 aa  110  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  42.98 
 
 		 559 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  45.45 
 
 		 461 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 768 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 1039 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 765 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 781 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 980 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 		 1276 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 		 550 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  43.8 
 
 		 669 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.11 
 
 		 1032 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 500 aa  107  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  44.26 
 
 		 479 aa  107  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.24 
 
 		 1111 aa  106  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  40.16 
 
 		 440 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 984 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 1325 aa  104  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 1121 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 656 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 196 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 2072 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 474 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 878 aa  100  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 901 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 1045 aa  100  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 		 759 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 		 287 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 		 483 aa  98.6  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 347 aa  97.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 720 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 596 aa  96.3  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 		 758 aa  94.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 764 aa  95.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  36.07 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 472 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 737 aa  90.9  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 619 aa  90.5  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 133 aa  90.5  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  38.89 
 
 		 906 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 		 458 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  41.8 
 
 		 632 aa  88.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  40.65 
 
 		 455 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 991 aa  83.6  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 921 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 896 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.84 
 
 		 700 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 685 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 		 473 aa  78.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.753978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.6 
 
 		 712 aa  77.4  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 477 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 1425 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>