More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1697 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  100 
 
 		 164 aa  342  1e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1023  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 128 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.530348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0332  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 		 769 aa  104  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  51.43 
 
 		 669 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.65 
 
 		 1078 aa  101  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 657 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  40.32 
 
 		 849 aa  97.4  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 530 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 771 aa  96.7  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 765 aa  95.5  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 653 aa  94.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  46.74 
 
 		 268 aa  94.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  50.55 
 
 		 637 aa  94.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48 
 
 		 603 aa  94.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 1301 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 		 813 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 1276 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 		 886 aa  93.6  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  54.88 
 
 		 837 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 763 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 544 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 789 aa  92  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  44.09 
 
 		 1113 aa  91.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 		 440 aa  91.3  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 896 aa  91.3  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 781 aa  90.9  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 766 aa  90.5  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 873 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1513 aa  90.1  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.19 
 
 		 862 aa  89.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 		 524 aa  89  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 593 aa  88.6  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 1426 aa  88.6  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 909 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 1032 aa  88.6  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  38.52 
 
 		 400 aa  88.6  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 768 aa  88.6  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 660 aa  87.4  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 1439 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  40.22 
 
 		 186 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 931 aa  85.5  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 		 1039 aa  85.5  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 1253 aa  85.1  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  42.7 
 
 		 1265 aa  85.1  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  41.86 
 
 		 402 aa  84  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 901 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 608 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  44.19 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 980 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 500 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.12 
 
 		 753 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  38.52 
 
 		 812 aa  81.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 550 aa  81.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 596 aa  80.9  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 644 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 		 559 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  36.89 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 		 511 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 783 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 603 aa  78.2  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 656 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 		 458 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 1045 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 472 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  40.22 
 
 		 632 aa  73.9  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 619 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 1425 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 984 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2037  response regulator receiver domain-containing protein  35.92 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119709  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 		 2072 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 1111 aa  71.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 347 aa  71.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 1039 aa  70.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 991 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 1325 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 759 aa  67.4  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.77 
 
 		 1121 aa  67.4  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 921 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 720 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 906 aa  66.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  37.08 
 
 		 746 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 		 455 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3268  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 483 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  30.65 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 758 aa  65.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0731  response regulator receiver protein  35.87 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2031  response regulator receiver domain-containing protein  45.31 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165379  normal  0.502331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 685 aa  64.3  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 878 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  32.79 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 764 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 		 508 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3076  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.15 
 
 		 454 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>