More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1023 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1023  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  266  5.9999999999999995e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.530348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0332  response regulator receiver protein  58.73 
 
 		 147 aa  161  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  46.03 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 813 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 		 669 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 347 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 653 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 789 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 1078 aa  72  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 657 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 657 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 		 376 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 764 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 984 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 781 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  38.84 
 
 		 637 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 530 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 862 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 		 837 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 909 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 769 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  37.14 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  34.96 
 
 		 1265 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 685 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 656 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2037  response regulator receiver domain-containing protein  32.76 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119709  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 644 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 593 aa  67  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 1513 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 886 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 766 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 1032 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 768 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 980 aa  65.1  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 1439 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 559 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 763 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 596 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 1045 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 		 812 aa  64.3  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 544 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 603 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 		 906 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 765 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  34.62 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  31.15 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 1039 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 720 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 500 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 		 632 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 550 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 		 400 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 783 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 619 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1301 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 472 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 771 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 461 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 196 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  37.63 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  35.05 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 1039 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  29.27 
 
 		 458 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 603 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 511 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 631 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 		 483 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.31 
 
 		 466 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 678 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  33.62 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 921 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 896 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 		 849 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 524 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 901 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 931 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 991 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0510  putative PAS/PAC sensor protein  32.69 
 
 		 455 aa  57.4  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1253 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 2072 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  37.8 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1426 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  29.06 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 1111 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2273  response regulator receiver protein  29.13 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2290  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 608 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 873 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1113 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 896 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 759 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 758 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 457 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2534  sensory box/response regulator  31.07 
 
 		 452 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 1425 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>