More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1771 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  463  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  73.68 
 
 		 228 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.68 
 
 		 228 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  73.25 
 
 		 228 aa  356  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  72.81 
 
 		 228 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  72.81 
 
 		 228 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  69.37 
 
 		 227 aa  341  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  69.37 
 
 		 227 aa  341  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  68.92 
 
 		 227 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  73.25 
 
 		 228 aa  330  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  73.25 
 
 		 228 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  68.44 
 
 		 227 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.67 
 
 		 228 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  65.79 
 
 		 228 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.67 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 240 aa  322  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  67.11 
 
 		 256 aa  321  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  68.92 
 
 		 253 aa  320  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  320  9.000000000000001e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  65.64 
 
 		 228 aa  318  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 		 228 aa  317  9e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.7 
 
 		 227 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  67.57 
 
 		 227 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  64.91 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.81 
 
 		 227 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.91 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.91 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  66.08 
 
 		 228 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  65.64 
 
 		 228 aa  311  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  66.51 
 
 		 232 aa  293  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.04 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  53.81 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  55.02 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  41.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  41.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  36.56 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  36.09 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  39.06 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  36.48 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.89 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.62 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  134  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1322  DNA-binding response regulator  36.73 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.423029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  39.65 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  35.47 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  36.04 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  36.96 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 224 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.18 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 229 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  36.61 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  34.03 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  36.05 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>