More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2950 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  100 
 
 
256 aa  529  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  70.13 
 
 
240 aa  339  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  70.8 
 
 
228 aa  337  9e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  74.45 
 
 
232 aa  335  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  69.03 
 
 
228 aa  328  6e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  68.58 
 
 
228 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  67.26 
 
 
228 aa  322  5e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  69.37 
 
 
227 aa  321  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  69.37 
 
 
227 aa  321  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  67.11 
 
 
228 aa  321  9.000000000000001e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  68.92 
 
 
227 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  67.56 
 
 
228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  68.14 
 
 
228 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  68.14 
 
 
228 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  67.11 
 
 
228 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 
228 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  67.11 
 
 
228 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  67.86 
 
 
227 aa  311  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.11 
 
 
228 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  67.26 
 
 
228 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  66.07 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.32 
 
 
227 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  67.57 
 
 
227 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.32 
 
 
227 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.18 
 
 
228 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  64.09 
 
 
228 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  61.5 
 
 
228 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.62 
 
 
228 aa  289  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  60.17 
 
 
235 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.06 
 
 
228 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.62 
 
 
228 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  63.18 
 
 
228 aa  285  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 
228 aa  281  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  65.78 
 
 
228 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 
240 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.52 
 
 
238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  51.58 
 
 
228 aa  256  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  44.13 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 
235 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 
235 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 
235 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  39.83 
 
 
235 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  39.83 
 
 
235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  39.66 
 
 
235 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
235 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  39.83 
 
 
235 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
235 aa  154  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.09 
 
 
226 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  39.21 
 
 
229 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 
237 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 
226 aa  149  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 
237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.38 
 
 
226 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  39.74 
 
 
233 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
228 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 
232 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  36.68 
 
 
228 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 
228 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  37.78 
 
 
229 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 
242 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 
226 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 
226 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  39.47 
 
 
230 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.13 
 
 
229 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 
245 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  36.13 
 
 
234 aa  141  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 
226 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 
224 aa  141  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  37.12 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  37.61 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.61 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 
248 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 
233 aa  139  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  37.18 
 
 
248 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
228 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  35.95 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  39.04 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 
228 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 
235 aa  138  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 
229 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 
226 aa  138  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 
235 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>