More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5036 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  74.45 
 
 		 256 aa  355  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  72.37 
 
 		 240 aa  344  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.54 
 
 		 228 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  67.11 
 
 		 228 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  67.7 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  66.23 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 228 aa  315  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  66.23 
 
 		 228 aa  314  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  70.35 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  70.35 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  65.62 
 
 		 227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  70.35 
 
 		 228 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  66.37 
 
 		 228 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  65.62 
 
 		 227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  65.18 
 
 		 227 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  65.93 
 
 		 228 aa  307  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 228 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.04 
 
 		 228 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  65.49 
 
 		 228 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  67.98 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  67.25 
 
 		 253 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  67.41 
 
 		 227 aa  301  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  63.16 
 
 		 228 aa  301  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.91 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 		 227 aa  298  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  64.47 
 
 		 235 aa  298  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.47 
 
 		 228 aa  297  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.94 
 
 		 228 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.07 
 
 		 227 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  63.32 
 
 		 228 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  65.79 
 
 		 228 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  65.79 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  59.05 
 
 		 240 aa  269  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  53.6 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.71 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  38.46 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  40.43 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.34 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 224 aa  141  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.66 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  34.8 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  34.03 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 261 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  34.8 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  38.26 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.77 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.52 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  37.44 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  40.17 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  39.82 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.33 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3804  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 		 245 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1977  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.166768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.96 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.83 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  41.74 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.91 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>