More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0059 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 227 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 		 227 aa  288  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  58.41 
 
 		 227 aa  286  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 228 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  55.95 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.87 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  55.2 
 
 		 228 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  54.5 
 
 		 228 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  51.12 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 228 aa  252  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  54.03 
 
 		 232 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 228 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 270 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  34.63 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  32.47 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  33.48 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  32.48 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  32.48 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.07 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  32.48 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.22 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  32.43 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  29.96 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  29.96 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  31.14 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  28.85 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.07 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 799 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0898  DNA-binding response regulator  28.12 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  29.57 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  29.33 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  28.82 
 
 		 242 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  30.9 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  30.04 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  31.06 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  30.84 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  30.67 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  30.67 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>