More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0763 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  79.57 
 
 		 226 aa  366  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0808  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  75.45 
 
 		 226 aa  355  2.9999999999999997e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000531821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  76.68 
 
 		 225 aa  349  2e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  67.86 
 
 		 224 aa  322  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  68.75 
 
 		 224 aa  322  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  68.3 
 
 		 224 aa  322  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  68.3 
 
 		 224 aa  322  4e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1384  response regulator receiver  67.54 
 
 		 226 aa  301  7.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  58.56 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0564  response regulator receiver  56.95 
 
 		 223 aa  258  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.924373  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2094  response regulator receiver  56.56 
 
 		 225 aa  257  9e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1147  regulatory protein VanR  57.14 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0966  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  56.95 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00233107  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1360  transcriptional regulatory protein BaeR  56.95 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1135  transcriptional regulatory protein BaeR  56.05 
 
 		 223 aa  248  8e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0494  two-component response regulator  53.3 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0464  DNA-binding response regulator  52.02 
 
 		 223 aa  231  5e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1397  DNA-binding response regulator  52.02 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1277  DNA-binding response regulator  52.02 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112244  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2131  response regulator receiver  50.67 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  46.22 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.4 
 
 		 233 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.44 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.44 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.49 
 
 		 247 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  40.18 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  40.18 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  38.84 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.24 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.23 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.23 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.16 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.36 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  33.64 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.33 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  33.62 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  35.4 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 240 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 321 aa  149  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  35.43 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  35.32 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  36.2 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  34.63 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 247 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  37.95 
 
 		 236 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  33.63 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  33.18 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  35.71 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  35.9 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>