More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2131 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2131  response regulator receiver  100 
 
 		 223 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0808  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  51.1 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000531821  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  50.45 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1384  response regulator receiver  51.54 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  49.11 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  49.11 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0564  response regulator receiver  50.67 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.924373  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1360  transcriptional regulatory protein BaeR  51.33 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0966  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  50.88 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00233107  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  48.67 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1135  transcriptional regulatory protein BaeR  48.67 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0494  two-component response regulator  47.79 
 
 		 223 aa  209  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0464  DNA-binding response regulator  48.44 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316679  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1397  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1277  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112244  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1147  regulatory protein VanR  48.02 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2094  response regulator receiver  45.7 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 241 aa  175  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  41.78 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  36.73 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  35 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  37.17 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  39.57 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 245 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.12 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  34.55 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 229 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  34.36 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  37.05 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.17 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  37.05 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 251 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  36.12 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.78 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  32.62 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.96 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  36.4 
 
 		 241 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.12 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 244 aa  141  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  34.36 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.79 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  35.5 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>