More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0564 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0564  response regulator receiver  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.924373  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0966  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  79.37 
 
 		 223 aa  363  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00233107  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1360  transcriptional regulatory protein BaeR  78.92 
 
 		 223 aa  363  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1135  transcriptional regulatory protein BaeR  78.92 
 
 		 223 aa  363  2e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169621  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1147  regulatory protein VanR  77.68 
 
 		 224 aa  358  5e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0494  two-component response regulator  77.58 
 
 		 223 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1397  DNA-binding response regulator  69.96 
 
 		 223 aa  327  7e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1277  DNA-binding response regulator  69.96 
 
 		 223 aa  327  7e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112244  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0464  DNA-binding response regulator  69.06 
 
 		 223 aa  324  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2094  response regulator receiver  59.73 
 
 		 225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  56.7 
 
 		 225 aa  261  6e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  56.95 
 
 		 224 aa  258  4e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  55.56 
 
 		 226 aa  257  8e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  56.7 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  57.14 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0808  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  56 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000531821  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  56.7 
 
 		 224 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  55.8 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1384  response regulator receiver  53.78 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2131  response regulator receiver  50.67 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  43.75 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 		 239 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  38.43 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.33 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.17 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.33 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 242 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 238 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  37.77 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.82 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.68 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 252 aa  154  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.05 
 
 		 226 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  34.76 
 
 		 240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.2 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  37.61 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.17 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  37.99 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  37.18 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  37.18 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.18 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  37.18 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  37.18 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  37.18 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2529  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  35.93 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  37.61 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  37.61 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  37.72 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  36.4 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1287  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  35.56 
 
 		 225 aa  148  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 251 aa  148  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 239 aa  148  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.44 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  36.84 
 
 		 236 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  36.73 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.39 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 222 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  36.29 
 
 		 241 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.08 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>