49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4627 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3737  response regulator receiver protein  100 
 
 		 415 aa  856    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00211748  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4627  response regulator receiver protein  100 
 
 		 415 aa  856    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485266  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6520  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143497  normal  0.120873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  36.8 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1101  purine or other phosphorylase family 1  32.43 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  33.58 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6154  response regulator receiver protein  30.54 
 
 		 414 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1534  response regulator receiver domain-containing protein  28.19 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00802449  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3318  response regulator receiver domain-containing protein  24.94 
 
 		 379 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625003  normal  0.154296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1423  nucleoside phosphorylase-like  33.33 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  24.3 
 
 		 508 aa  56.6  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1432  purine phosphorylases family protein 1  25.91 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  22.68 
 
 		 1050 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.97 
 
 		 231 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1589  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.1 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.81 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4179  purine or other phosphorylase family 1  25.86 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.02759  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1338  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.39 
 
 		 272 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3244  response regulator receiver protein  26.57 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1427  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0301  hypothetical protein  29.5 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.00000593331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 125 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.35 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 125 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 125 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2938  two component signal transduction response regulator  36.46 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.03674e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1421  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.31 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.777512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0961  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.3 
 
 		 264 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1443  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.3 
 
 		 264 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4587  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.28 
 
 		 264 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  46.6  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.85 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 890 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00434081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 121 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1872  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.74 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170055  normal  0.0118137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2059  purine phosphorylase family 1  21.57 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  23.79 
 
 		 662 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.7 
 
 		 227 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  30.69 
 
 		 912 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  32.48 
 
 		 229 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  25.56 
 
 		 217 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.38 
 
 		 266 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4371  purine phosphorylase family 1  22.93 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1323  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.28 
 
 		 268 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1364  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.28 
 
 		 264 aa  43.9  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370611 
 
 
-
 
NC_002620  TC0753  sigma-54 dependent response regulator  33.68 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0986  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 143 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  27.48 
 
 		 255 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2238  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 140 aa  43.1  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0218186  hitchhiker  0.00000354209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>