30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1101 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1101  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 		 411 aa  852    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  44.42 
 
 		 407 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6520  response regulator receiver protein  37.8 
 
 		 406 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143497  normal  0.120873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4627  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485266  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3737  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00211748  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  34.66 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6154  response regulator receiver protein  30.32 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1534  response regulator receiver domain-containing protein  25.06 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00802449  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3318  response regulator receiver domain-containing protein  24.01 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625003  normal  0.154296 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3244  response regulator receiver protein  26.27 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  23.55 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1423  nucleoside phosphorylase-like  34.96 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0301  hypothetical protein  25.95 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.00000593331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  22.99 
 
 		 1050 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1241  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4034  purine or other phosphorylase family 1  26.64 
 
 		 302 aa  46.6  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3545  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.23 
 
 		 569 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5845  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 195 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.683493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.39 
 
 		 948 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 607 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 370 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 242 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4179  purine or other phosphorylase family 1  24.05 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.02759  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3735  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 459 aa  43.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0068  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.92 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1426  nucleoside phosphorylase-like  30 
 
 		 129 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 1011 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2035  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.806395  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 251 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 		 228 aa  43.1  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>