More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4899 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  69.36 
 
 
608 aa  754    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  90.76 
 
 
613 aa  1062    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
607 aa  1230    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
594 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  33.5 
 
 
602 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
603 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
611 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
610 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  33.28 
 
 
610 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
610 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
602 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
606 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  31.8 
 
 
602 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
606 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0100  histidine kinase  27.27 
 
 
572 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102093  normal  0.549311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  28.87 
 
 
547 aa  206  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1005 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.46 
 
 
1535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1022 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1069 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
729 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
579 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  34.28 
 
 
952 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 
846 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  36.22 
 
 
835 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  34.28 
 
 
988 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  34.28 
 
 
1014 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
880 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  34.28 
 
 
1032 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1352 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.85 
 
 
1109 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  31.5 
 
 
578 aa  187  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  29.48 
 
 
630 aa  186  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  31.22 
 
 
576 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1055 aa  186  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1003 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  29.24 
 
 
630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2306  histidine kinase  30.66 
 
 
479 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.808548  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
907 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
697 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  29.38 
 
 
732 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
957 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
741 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
869 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.97 
 
 
1346 aa  183  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
863 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  32.39 
 
 
984 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
832 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
977 aa  182  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
810 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
1003 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1001 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 
896 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
970 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.11 
 
 
923 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
827 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1358 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
868 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 
1433 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
687 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
572 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.43 
 
 
582 aa  179  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
791 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
765 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
507 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
696 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.46 
 
 
822 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  31.28 
 
 
1407 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 
767 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  34.41 
 
 
539 aa  179  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
592 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
1124 aa  178  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
1271 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
1002 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
736 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1002 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  30.42 
 
 
544 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  28.94 
 
 
1121 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
865 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  31.87 
 
 
661 aa  177  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
631 aa  177  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  32.66 
 
 
566 aa  177  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
995 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
917 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  29.01 
 
 
736 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
964 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
796 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  31 
 
 
882 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  32.02 
 
 
733 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
818 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1131 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
823 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
902 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.08 
 
 
1442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  30.46 
 
 
758 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
1255 aa  174  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  32.85 
 
 
793 aa  174  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
788 aa  174  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>