More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1771 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  90.76 
 
 
607 aa  1062    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
613 aa  1238    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  69.72 
 
 
608 aa  744    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
594 aa  286  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
611 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  34.47 
 
 
602 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  34.47 
 
 
602 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
610 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
610 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  34.34 
 
 
610 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  33.22 
 
 
602 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
606 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
601 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
606 aa  256  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  28.9 
 
 
547 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0100  histidine kinase  27.35 
 
 
572 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.102093  normal  0.549311 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
579 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1005 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
1022 aa  193  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
1352 aa  191  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1069 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  32.93 
 
 
729 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.25 
 
 
1535 aa  188  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  34.81 
 
 
952 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
1433 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  35.81 
 
 
835 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1003 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.1 
 
 
582 aa  185  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  29.88 
 
 
630 aa  183  6e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
810 aa  183  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
907 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
572 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2833  histidine kinase  30.29 
 
 
576 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  29.63 
 
 
630 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  33.59 
 
 
988 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
697 aa  182  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
957 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
823 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  33.59 
 
 
1032 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  33.59 
 
 
1014 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  29.72 
 
 
732 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
796 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1358 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1197 aa  180  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
846 aa  180  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
869 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
767 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
643 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2306  histidine kinase  30.56 
 
 
479 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.808548  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
696 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1003 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  31.07 
 
 
544 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  33.13 
 
 
736 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  33.07 
 
 
661 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1055 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
741 aa  178  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.66 
 
 
1346 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
1001 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
593 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1012  response regulator, histidine kinase  30.36 
 
 
578 aa  177  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
1124 aa  177  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
827 aa  176  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
864 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
977 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.72 
 
 
1109 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
880 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  31.94 
 
 
793 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
902 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
863 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
687 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
644 aa  175  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  31.1 
 
 
1407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 
633 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 
970 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.65 
 
 
1442 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1284 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
791 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
818 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
770 aa  174  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1267 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
964 aa  174  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
832 aa  173  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
592 aa  173  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
896 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
1166 aa  173  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
1271 aa  173  6.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.25 
 
 
1193 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
643 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
932 aa  173  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
631 aa  173  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.61 
 
 
1629 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
974 aa  173  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
1002 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
1146 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
687 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
627 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.13 
 
 
2035 aa  172  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
507 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0550144  normal  0.563731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>