More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4800 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0794  sensory box histidine kinase/response regulator  65.13 
 
 
602 aa  794    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4148  histidine kinase  100 
 
 
610 aa  1234    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0955  putative two-component regulator histidine sensor kinase  65.62 
 
 
602 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2888  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  89.02 
 
 
606 aa  1078    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0633  MmoS, putative  66.28 
 
 
602 aa  804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  65.46 
 
 
611 aa  796    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4800  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
610 aa  1234    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5222  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  76.68 
 
 
601 aa  870    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747802  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3302  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  94.09 
 
 
606 aa  1137    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00552774 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  85.39 
 
 
603 aa  1033    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3368  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
610 aa  1234    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0390016  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
608 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  hitchhiker  0.000174254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
613 aa  257  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 
607 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4735  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
594 aa  229  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1029 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
813 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  31.91 
 
 
1364 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4054  histidine kinase  29.15 
 
 
547 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
1120 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
1433 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  31.94 
 
 
2051 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
913 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
641 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
877 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 
695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  30.89 
 
 
984 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  31.92 
 
 
806 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  29.28 
 
 
1060 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.8 
 
 
1331 aa  163  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1603 aa  163  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  29.43 
 
 
982 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
663 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
947 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  30.9 
 
 
742 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  31.58 
 
 
853 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
781 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  30.23 
 
 
945 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  29.44 
 
 
676 aa  161  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  30.88 
 
 
666 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  28.08 
 
 
882 aa  161  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  28.73 
 
 
1026 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  30.18 
 
 
948 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
951 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1202 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5313  histidine kinase  32.65 
 
 
710 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0905538 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
1261 aa  160  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
664 aa  160  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
1127 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
784 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  34.25 
 
 
1177 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
974 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.12 
 
 
784 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 
801 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1363 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  29.97 
 
 
630 aa  159  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1323 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
846 aa  158  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  28.28 
 
 
797 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  31.55 
 
 
550 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
572 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
957 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  29.72 
 
 
630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34.37 
 
 
1361 aa  157  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
524 aa  156  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1187 aa  156  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
893 aa  156  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
865 aa  156  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
1075 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  31.96 
 
 
1001 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02280  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.49 
 
 
509 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  25.05 
 
 
736 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 
1350 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  30.03 
 
 
810 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
708 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  27.01 
 
 
603 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1791 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
907 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
1199 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
827 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
737 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
768 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
768 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
995 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1977  histidine kinase  32.91 
 
 
534 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.313704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
1214 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
1070 aa  154  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
977 aa  153  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1099 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  28.91 
 
 
1322 aa  153  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 
597 aa  153  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  29.6 
 
 
1023 aa  153  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
846 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  27.55 
 
 
1000 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
869 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  29.24 
 
 
578 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 
1452 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
1305 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  26.89 
 
 
968 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>