55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6520 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6520  response regulator receiver protein  100 
 
 		 406 aa  831    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143497  normal  0.120873 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3737  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00211748  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4627  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1101  purine or other phosphorylase family 1  37.8 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6154  response regulator receiver protein  34.14 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0542  response regulator receiver domain-containing protein  34.34 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0563  response regulator receiver domain-containing protein  37.81 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1534  response regulator receiver domain-containing protein  27.7 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00802449  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3318  response regulator receiver domain-containing protein  27.65 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625003  normal  0.154296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1423  nucleoside phosphorylase-like  34.43 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.180794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3658  nucleoside phosphorylase-like protein  24.81 
 
 		 1050 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4195  purine phosphorylase family 1  22.92 
 
 		 508 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1432  purine phosphorylases family protein 1  26.94 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I07  MTA/SAH nucleosidase  21.89 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.179437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4179  purine or other phosphorylase family 1  25.12 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.02759  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 		 662 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3244  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2059  purine phosphorylase family 1  26.69 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1426  nucleoside phosphorylase-like  38.55 
 
 		 129 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1323  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.23 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4371  purine phosphorylase family 1  26.69 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.744094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1364  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.23 
 
 		 264 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.370611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.6 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0953  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.38 
 
 		 251 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2372  phosphorylase  22.86 
 
 		 944 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0103338  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1427  hypothetical protein  40.74 
 
 		 143 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1098  purine phosphorylases family protein 1  24.15 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0301  hypothetical protein  24.81 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705452  decreased coverage  0.00000593331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.46 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1872  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.77 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170055  normal  0.0118137 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1166  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.95 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 1185 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.65 
 
 		 258 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.781096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.38 
 
 		 240 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7561  Nucleoside phosphorylase-like protein  24.23 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6521  response regulator receiver protein  30.14 
 
 		 151 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.557152  normal  0.106404 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0377  putative nucleosidase, Pfs protein  25.13 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1818  S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.02 
 
 		 235 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.2648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  28.19 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2883  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.38 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4034  purine or other phosphorylase family 1  26.88 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 1177 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1338  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.51 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2376  S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.4 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.769598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0127  purine nucleoside phosphorylase  30.56 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.391631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0122  purine nucleoside phosphorylase  30.56 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000853984  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  27.81 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.1 
 
 		 233 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1254  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 472 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.388952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0295  purine nucleoside phosphorylase  25.51 
 
 		 232 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0663  purine nucleoside phosphorylase  27.62 
 
 		 243 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1747  purine nucleoside phosphorylase  26.26 
 
 		 236 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 		 1128 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3383  purine or other phosphorylase family 1  26.29 
 
 		 255 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>