More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0418 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  246  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2047  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2817  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3210  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0776  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000835167  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2012  response regulator receiver domain-containing protein  42.24 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.631712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2765  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.557597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1291  response regulator  40.16 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1018  response regulator receiver domain-containing protein  40.17 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1786  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4605  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3940  putative two-component response regulatory protein, response regulator receiver  39.17 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2841  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.13 
 
 		 916 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2510  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  40.59 
 
 		 448 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  34.13 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3572  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 457 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 448 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2234  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  37.39 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.13 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1237 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  34.15 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 230 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3722  response regulator receiver  37.4 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  34.15 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  33.9 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3040  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.638126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3041  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.605756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 310 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 455 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2018  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 447 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4192  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 454 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00227342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1966  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0440  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0439  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 230 aa  70.1  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 265 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 232 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  35.43 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0613  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  31.4 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.79 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2171  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0561  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  40.37 
 
 		 394 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  31.4 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 760 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1122 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  33.61 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 850 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  32.8 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3131  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.164774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  32.77 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0669  putative twitching motility two-component response regulator transcription regulator protein  31.9 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  34.45 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>