More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1291 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1291  response regulator  100 
 
 		 123 aa  245  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2841  response regulator receiver protein  48.18 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2765  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.557597  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2171  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2012  response regulator receiver domain-containing protein  47.79 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.631712 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3210  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 124 aa  93.6  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1786  response regulator receiver protein  44.64 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0776  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000835167  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2047  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2817  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1018  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  30.65 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1660  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2553  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1194499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3131  response regulator receiver domain-containing protein  34.38 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.164774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  32.76 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.78 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.21 
 
 		 462 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0776  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0195762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  37.3 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2810  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0130618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  31.13 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0226  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1018 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  35 
 
 		 785 aa  63.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 219 aa  63.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00404304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  34.13 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  30.33 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1039 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  33.06 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 751 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0984  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0887  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 846 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0778  response regulator receiver domain-containing protein  42.7 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1016 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  31.62 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 872 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  33.33 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  30.19 
 
 		 234 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.21 
 
 		 473 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00584  response regulator  32.23 
 
 		 467 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  30.08 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 463 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 243 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.21 
 
 		 473 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0065  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.670969  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 371 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  28.93 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  31.48 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0719  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 307 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03140  two component response regulator transcription regulator protein  34.45 
 
 		 245 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2740  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.14 
 
 		 475 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0485  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  30.83 
 
 		 482 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0514361  normal  0.01861 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  30.83 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  34.13 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  32.77 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  32.77 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 915 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  28.68 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2651  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 483 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2023  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1021 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.36 
 
 		 589 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1981  two-component response regulator, sigma-54 related  34.57 
 
 		 448 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472322  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2835  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.14 
 
 		 475 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 387 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.736737  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2289  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 225 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  30.7 
 
 		 351 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 630 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  32.08 
 
 		 233 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>