More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1598 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  247  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  54.33 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  51.97 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  57.66 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  53.6 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  49.21 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  50.4 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4869  response regulator receiver domain-containing protein  52.63 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  56.14 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  51.16 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  53.28 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  53.28 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  53.28 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  50 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  50.82 
 
 		 119 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  49.18 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  50 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  41.8 
 
 		 120 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  43.55 
 
 		 1299 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  41.46 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 		 1048 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 120 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  41.8 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  40.98 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  40.98 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  41.67 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  40.16 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  40.16 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1390 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1390 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 		 1390 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1426 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  41.13 
 
 		 1427 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  40.98 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 1415 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  39.17 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  39.2 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1361 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.94 
 
 		 1514 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.94 
 
 		 1514 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 1385 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1651 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 		 1406 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 233 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  36.89 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 1039 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 1383 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1287 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 1370 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1559 aa  73.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  35.25 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.13 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  40 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 939 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 754 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 650 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  31.45 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2092  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.81 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.187111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2234  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.162422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1003 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 978 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 225 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 228 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  34.4 
 
 		 742 aa  69.3  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 941 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  33.61 
 
 		 538 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>