More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3094 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 119 aa  129  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  52.07 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  52.89 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  51.24 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  52.89 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  52.89 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  54.55 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  52.94 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  51.33 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  52.07 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4869  response regulator receiver domain-containing protein  52.68 
 
 		 123 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  55.37 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 803 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  32.73 
 
 		 845 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0446  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 481 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 480 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 474 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  39.34 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  37.19 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 906 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  38.66 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  37.9 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  37.19 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  37.19 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  33.9 
 
 		 866 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  37.19 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  34.75 
 
 		 903 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  38.02 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 903 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  33.33 
 
 		 892 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  37.1 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  37.1 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 925 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 888 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 811 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 556 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 853 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 622 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  40.68 
 
 		 622 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  35.24 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 542 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 890 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 622 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 840 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 846 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 869 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  35 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 793 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  38.98 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 867 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 853 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 769 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 628 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  34.71 
 
 		 945 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  34.71 
 
 		 945 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1983  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 847 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.138459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 867 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 857 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  34.51 
 
 		 872 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 872 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 588 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 880 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2604  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 459 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3081  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 638 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 905 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 839 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1883  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 250 aa  71.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.312103  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>