More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2719 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  98.33 
 
 		 120 aa  235  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  98.33 
 
 		 120 aa  235  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  95 
 
 		 121 aa  228  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  90.6 
 
 		 118 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  90.6 
 
 		 118 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  90.6 
 
 		 118 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  90.6 
 
 		 118 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  88.03 
 
 		 130 aa  213  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  88.03 
 
 		 120 aa  213  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  88.03 
 
 		 120 aa  213  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  88.03 
 
 		 118 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  88.03 
 
 		 118 aa  210  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  86.32 
 
 		 120 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  86.32 
 
 		 135 aa  207  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  86.32 
 
 		 119 aa  207  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  84.62 
 
 		 119 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  84.62 
 
 		 119 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  84.62 
 
 		 119 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  86.32 
 
 		 120 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  83.76 
 
 		 119 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  83.05 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  83.76 
 
 		 119 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  81.2 
 
 		 138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  79.49 
 
 		 120 aa  192  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  71.19 
 
 		 120 aa  172  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  67.5 
 
 		 121 aa  160  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  60 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  41.23 
 
 		 742 aa  90.5  6e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 542 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 817 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  41.38 
 
 		 829 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  40.68 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.09 
 
 		 824 aa  79.7  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  41.67 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 853 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  34.21 
 
 		 828 aa  78.6  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 698 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 713 aa  77.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 925 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 1013 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 890 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 		 417 aa  75.5  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  35.59 
 
 		 571 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 803 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 752 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 691 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 857 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  36.67 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  37.5 
 
 		 594 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1326  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000300613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  37.61 
 
 		 552 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 925 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 869 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  40 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 853 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 727 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  35.29 
 
 		 892 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 888 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 845 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 688 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  37.5 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05158  transcriptional regulatory protein CpxR  38.18 
 
 		 209 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.61 
 
 		 641 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6621  histidine kinase  36.75 
 
 		 552 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 661 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 641 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3222  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 798 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.150716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 943 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0648  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0471753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1039  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 798 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 688 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.63 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 		 945 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  34.19 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 939 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 660 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 845 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 853 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 625 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1079 aa  72  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 480 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 766 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 		 945 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 880 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 688 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 770 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>