More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1157 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  246  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  92.13 
 
 		 127 aa  229  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  85.12 
 
 		 121 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  83.47 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  83.47 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  62.9 
 
 		 125 aa  157  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  62.7 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  59.52 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  67.86 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  60.66 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  62.61 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4869  response regulator receiver domain-containing protein  61.61 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  53.72 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  52.07 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  52.07 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  54.1 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 443 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0537  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 446 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 443 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  48.8 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 803 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 939 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 811 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 		 905 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 542 aa  78.2  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2379  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373235  normal  0.0399931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  33.33 
 
 		 892 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0719  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.75 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 793 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  32.2 
 
 		 845 aa  74.7  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0626  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 460 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  41.18 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 230 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 754 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 941 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.67 
 
 		 447 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 888 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 461 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  36.13 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 872 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  37.7 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 860 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0087  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1260  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 331 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 556 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 379 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  36.79 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 958 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  35.54 
 
 		 872 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 220 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 239 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 462 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 		 226 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  35.24 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  39.67 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  39.67 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  37.29 
 
 		 829 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 661 aa  70.5  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 689 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  36.52 
 
 		 803 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  38.98 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 853 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.66 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 752 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  31.4 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 957 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>