More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0043 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  100 
 
 
118 aa  234  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  100 
 
 
118 aa  234  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  100 
 
 
118 aa  234  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  100 
 
 
118 aa  234  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  97.46 
 
 
118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  97.46 
 
 
118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  90.6 
 
 
120 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  89.74 
 
 
120 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  89.74 
 
 
120 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  88.03 
 
 
127 aa  209  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  87.93 
 
 
138 aa  208  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  88.03 
 
 
121 aa  207  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  84.62 
 
 
119 aa  204  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  84.62 
 
 
119 aa  204  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  83.76 
 
 
130 aa  204  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  84.62 
 
 
135 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  84.62 
 
 
119 aa  203  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  84.62 
 
 
120 aa  203  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  86.32 
 
 
120 aa  203  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  83.76 
 
 
120 aa  203  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  83.76 
 
 
120 aa  203  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  83.76 
 
 
119 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  83.76 
 
 
119 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  82.91 
 
 
119 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  76.07 
 
 
120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  71.79 
 
 
120 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  66.39 
 
 
121 aa  156  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  60.68 
 
 
118 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  60.34 
 
 
127 aa  141  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  59.48 
 
 
124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  55.56 
 
 
125 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
542 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  40.52 
 
 
829 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  38.05 
 
 
742 aa  81.3  0.000000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  41.03 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
853 aa  80.5  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
925 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  39.34 
 
 
121 aa  78.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
890 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  37.61 
 
 
892 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  37.61 
 
 
417 aa  78.2  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
869 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
556 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
1013 aa  76.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
853 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
857 aa  77  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
888 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
688 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  39.32 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
752 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
641 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
840 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
853 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
770 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
766 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
817 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.61 
 
 
641 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.23 
 
 
824 aa  74.7  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
774 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
691 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
688 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
713 aa  74.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
622 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0648  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0471753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  36.75 
 
 
552 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
688 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  35.04 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
828 aa  73.2  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6621  histidine kinase  35.9 
 
 
552 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
903 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
660 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
943 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  37.82 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  37.8 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
880 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.73 
 
 
472 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  38.66 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  38.66 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
548 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1034 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2449  response regulator receiver  35.9 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3527  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
839 aa  71.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.064663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4152  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.04 
 
 
480 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.038607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  34.75 
 
 
903 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  35.29 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  34.78 
 
 
573 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  36.21 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.04 
 
 
465 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  34.19 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
661 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
906 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  39.17 
 
 
945 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1326  response regulator receiver protein  37.62 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000300613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>