More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3644 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  256  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  88.03 
 
 		 118 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  88.03 
 
 		 118 aa  209  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  88.03 
 
 		 118 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  88.03 
 
 		 118 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  86.32 
 
 		 118 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  79.39 
 
 		 138 aa  208  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  86.32 
 
 		 118 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  83.76 
 
 		 119 aa  206  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  80.49 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  82.91 
 
 		 119 aa  202  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  83.05 
 
 		 120 aa  202  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  82.05 
 
 		 119 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  82.91 
 
 		 120 aa  200  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  82.05 
 
 		 119 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  82.05 
 
 		 119 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  82.91 
 
 		 120 aa  200  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  82.91 
 
 		 121 aa  200  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  81.2 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  82.05 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  77.78 
 
 		 130 aa  192  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  78.81 
 
 		 120 aa  192  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  77.78 
 
 		 120 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  77.78 
 
 		 120 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  73.5 
 
 		 120 aa  175  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  70.34 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  63.48 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  59.32 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  58.62 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 542 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.59 
 
 		 892 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 853 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  36.89 
 
 		 829 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  36.67 
 
 		 742 aa  76.6  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  36.75 
 
 		 552 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.04 
 
 		 824 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  38.98 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.14 
 
 		 472 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 817 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 857 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 853 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  40 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 		 828 aa  74.3  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 853 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6621  histidine kinase  35.04 
 
 		 552 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 888 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 925 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0648  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0471753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 688 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 890 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 941 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 880 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 698 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 774 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 943 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.61 
 
 		 641 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 691 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 869 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 1034 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 766 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 864 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  35.83 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 770 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 471 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 		 945 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 906 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 939 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 		 945 aa  70.1  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 949 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.75 
 
 		 465 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  33.33 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1013 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 840 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  37.39 
 
 		 949 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 857 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  38.4 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  32.2 
 
 		 903 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 942 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  33.62 
 
 		 538 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 752 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  34.19 
 
 		 594 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>