More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2750 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  237  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  87.5 
 
 		 130 aa  214  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  87.5 
 
 		 120 aa  213  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  87.5 
 
 		 120 aa  213  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  86.32 
 
 		 120 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  86.32 
 
 		 120 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  86.32 
 
 		 120 aa  208  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  86.44 
 
 		 121 aa  207  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  84.62 
 
 		 118 aa  204  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  84.62 
 
 		 118 aa  204  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  84.62 
 
 		 118 aa  203  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  84.62 
 
 		 118 aa  203  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  84.62 
 
 		 118 aa  203  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  84.62 
 
 		 118 aa  203  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  84.17 
 
 		 120 aa  200  6e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  78.15 
 
 		 119 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  78.15 
 
 		 119 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  77.31 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  77.31 
 
 		 119 aa  194  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  80 
 
 		 120 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  77.31 
 
 		 119 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  76.47 
 
 		 119 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  77.31 
 
 		 119 aa  193  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  78.81 
 
 		 127 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  78.63 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 120 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  67.77 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  60.83 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  60.83 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  40 
 
 		 742 aa  91.7  3e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 		 542 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.4 
 
 		 824 aa  83.2  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  38.33 
 
 		 417 aa  82  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  34.51 
 
 		 828 aa  82.4  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 853 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  40.34 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  40.87 
 
 		 829 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 691 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 888 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  38.33 
 
 		 866 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 857 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  41.32 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  38.66 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 925 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 853 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 472 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.21 
 
 		 892 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1013 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.18 
 
 		 641 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 811 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  39.67 
 
 		 945 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  39.67 
 
 		 945 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 890 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 817 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 688 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 622 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3223  histidine kinase  37.61 
 
 		 594 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00047761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  38.71 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 556 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 551 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 857 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  33.61 
 
 		 571 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 713 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00394135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 661 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 880 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 688 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 869 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  38.02 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0719  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 307 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 641 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 625 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  36.8 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  33.33 
 
 		 845 aa  71.2  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 688 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 853 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1326  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000300613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 943 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1154  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 925 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1130  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 840 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 495 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.07 
 
 		 465 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>