More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1998 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  236  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  71.79 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 120 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 118 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  71.79 
 
 		 118 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  71.19 
 
 		 120 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 120 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  70.94 
 
 		 120 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  70.83 
 
 		 130 aa  171  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  70.83 
 
 		 120 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  70.83 
 
 		 120 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  70.34 
 
 		 121 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  68.91 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  68.91 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  70.34 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  68.33 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  67.8 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  68.07 
 
 		 135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  68.07 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 119 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  67.23 
 
 		 119 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  67.23 
 
 		 119 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  68.6 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  65.83 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  65.55 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  60.34 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  61.21 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  55.83 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  49.6 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 542 aa  82.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  48.8 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  48 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 857 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  47.2 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  45 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  43.12 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  45 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  41.13 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 551 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  43.86 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 888 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  36.75 
 
 		 892 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  46.49 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4869  response regulator receiver domain-containing protein  44.74 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  43.55 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0719  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.09 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 853 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 853 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  39.5 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 801 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  31.62 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1013 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 811 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  37.93 
 
 		 829 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 443 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 794 aa  72.8  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 853 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 874 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 880 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  35.83 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 925 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0537  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 446 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.48 
 
 		 443 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 647 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  34.82 
 
 		 828 aa  70.9  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3443  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 223 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 906 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.82 
 
 		 824 aa  70.5  0.000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 845 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  35.8 
 
 		 224 aa  70.5  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 840 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  33.91 
 
 		 573 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.13 
 
 		 641 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 903 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0648  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0471753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 869 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2064  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 845 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  35.59 
 
 		 903 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 		 371 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 817 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  32.76 
 
 		 538 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 943 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.2 
 
 		 472 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3429  histidine kinase  34.48 
 
 		 538 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 379 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 796 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 		 872 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>