More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2507 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 120 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 120 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  67.5 
 
 		 120 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  67.77 
 
 		 120 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  67.23 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  67.23 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  66.39 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  66.39 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  64.46 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  68.6 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  67.77 
 
 		 118 aa  154  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  64.46 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  65.55 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  64.46 
 
 		 120 aa  153  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  64.46 
 
 		 120 aa  153  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  64.46 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  64.46 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  64.46 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  64.46 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  64.17 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  61.98 
 
 		 120 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  64.46 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  63.64 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  63.64 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 138 aa  147  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  59.32 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  55.46 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  53.91 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  45.45 
 
 		 119 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  42.98 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  43.97 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 811 aa  89.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  39.67 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  41.32 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 119 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 752 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 		 733 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2820  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  41.88 
 
 		 829 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  38.46 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 890 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.21 
 
 		 824 aa  81.3  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 857 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 869 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0755  sensor histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 		 828 aa  80.1  0.000000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 888 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1228  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 769 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 853 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4869  response regulator receiver domain-containing protein  40.54 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.697748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 853 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 853 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 925 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 840 aa  76.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 770 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 766 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 650 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 906 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  37.4 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2146  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41399  hitchhiker  0.000968824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 542 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1889  ATPase domain-containing protein  35.29 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.508337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0366  sensor histidine kinase/response regulator  35.09 
 
 		 742 aa  75.5  0.0000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 740 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2110  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3757  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2716  response regulator  33.05 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.79 
 
 		 465 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2006  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 695 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  35.04 
 
 		 892 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 556 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 661 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  34.23 
 
 		 845 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  37.35 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 903 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 720 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 556 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1013 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  40.96 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 766 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 803 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0595  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 680 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3461  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2604  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  36.44 
 
 		 903 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  34.26 
 
 		 571 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>