More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0863 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0863  response regulator receiver protein  100 
 
 		 118 aa  233  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  67.77 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2946  response regulator receiver  63.03 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4515  response regulator receiver domain-containing protein  63.03 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.403365  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4356  response regulator receiver  63.03 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00220083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1143  response regulator receiver domain-containing protein  63.03 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0781  response regulator receiver domain-containing protein  62.18 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.394955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1391  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  63.03 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00446889  normal  0.206531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2816  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101903  normal  0.104606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0976  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351318  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4284  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0043  response regulator  63.03 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.868286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0040  response regulator  63.03 
 
 		 120 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2719  response regulator receiver protein  61.86 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0959171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2750  response regulator receiver protein  63.03 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000684047  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1998  response regulator receiver protein  65.55 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000230643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3746  chemotaxis response regulator  60.68 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.193057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5217  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5952  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0493294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3276  response regulator receiver  60.68 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3600  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3474  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.790484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0043  response regulator receiver protein  60.68 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0842812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3325  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 120 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3624  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 120 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3644  response regulator receiver protein  59.32 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00272169  normal  0.799381 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0612  response regulator  59.66 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.124392  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1234  response regulator receiver protein  55.93 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0344647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0135  response regulator receiver protein  58.97 
 
 		 124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1335  response regulator receiver protein  57.26 
 
 		 125 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51819  normal  0.0884587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1287  response regulator receiver domain-containing protein  55.56 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.442215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3569  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 119 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3862  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762525  normal  0.105944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4635  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 857 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576155  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4023  two component response regulator  43.7 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1598  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1446  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 811 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3086  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 766 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1157  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3997  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0883649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2980  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3094  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2860  response regulator receiver  42.98 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.388237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 770 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2540  response regulator receiver protein  46.22 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.676292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 890 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5149  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 869 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  35.25 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2198  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16592  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1385  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 695 aa  77.4  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1216  sensor histidine kinase/response regulator  35.54 
 
 		 417 aa  77  0.00000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1174  putative two-component response regulator  38.84 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  35.04 
 
 		 538 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1138  Signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 888 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.408537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2554  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 766 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 939 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0574  response regulator receiver  44.83 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.4385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1398  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 853 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4405  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 880 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0198095  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  33.9 
 
 		 571 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0848  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 698 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.132769  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 754 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1984  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 752 aa  73.9  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0665  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.709306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3429  histidine kinase  34.19 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.03 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0891  response regulator receiver domain-containing protein  34.19 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3461  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0941  response regulator receiver  42.62 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  37.04 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.64 
 
 		 472 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1802  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5220  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 817 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 774 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0462938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1076 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1985  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 650 aa  72  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 853 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 743 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 864 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 589 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1649  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 236 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 941 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.17 
 
 		 461 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.62039e-17 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 556 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 840 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0319  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.23 
 
 		 824 aa  71.2  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.655044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 874 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1522  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.17 
 
 		 461 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 853 aa  71.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1827  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.32093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 925 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 655 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0832  response regulator receiver domain-containing protein  44.64 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155773  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 556 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  33.9 
 
 		 866 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>