More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4162 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  72.41 
 
 
236 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  59.21 
 
 
237 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.77 
 
 
237 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.77 
 
 
237 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 
268 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.77 
 
 
235 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 
228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 
228 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 
259 aa  208  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 
271 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 
237 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 
236 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
237 aa  203  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 
245 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 
245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
234 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
234 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
227 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
242 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
242 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
242 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
242 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
242 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  45.85 
 
 
242 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
246 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 
246 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 
234 aa  188  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
234 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
234 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
234 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  43.81 
 
 
246 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
296 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 
238 aa  181  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
227 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.92 
 
 
242 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 
237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 
237 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  38.66 
 
 
238 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 
228 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  38.56 
 
 
238 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 
231 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 
265 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 
198 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 
230 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 
389 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 
241 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
248 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  39.38 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 
223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  34.96 
 
 
223 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 
223 aa  151  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  35.4 
 
 
223 aa  151  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 
223 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 
223 aa  151  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  34.51 
 
 
223 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 
261 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 
260 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 
260 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  37.12 
 
 
230 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 
236 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 
223 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 
227 aa  147  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  38.03 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 
226 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 
225 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  37.89 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 
236 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 
231 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 
231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.55 
 
 
229 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 
238 aa  144  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  38.05 
 
 
228 aa  144  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 
228 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 
228 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 
228 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 
228 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 
234 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>