109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2873 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  100 
 
 		 830 aa  1707    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 945 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 1450 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  32.67 
 
 		 527 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  37.5 
 
 		 848 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1149 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1123 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1238 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  34.51 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  29.68 
 
 		 941 aa  62.4  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.15 
 
 		 1279 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  30.06 
 
 		 1180 aa  60.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.11 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 850 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 817 aa  58.9  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  30.89 
 
 		 724 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  28.24 
 
 		 946 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.32 
 
 		 1441 aa  57.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  32.3 
 
 		 398 aa  56.6  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  29.03 
 
 		 775 aa  56.6  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 		 636 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  23.21 
 
 		 490 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 833 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.66 
 
 		 807 aa  55.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 828 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 833 aa  54.7  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 567 aa  54.7  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 828 aa  54.7  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46231  predicted protein  30 
 
 		 557 aa  54.7  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 1261 aa  54.3  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1526 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.02 
 
 		 1040 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.96 
 
 		 782 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 754 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  23.38 
 
 		 1104 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.6 
 
 		 742 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  31.51 
 
 		 681 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  26.58 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  28.8 
 
 		 596 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 545 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  23.73 
 
 		 1022 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.35 
 
 		 732 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2412  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 263 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 754 aa  52  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1911 aa  52  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  26.99 
 
 		 600 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6033  histidine kinase  21.97 
 
 		 726 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579668 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.94 
 
 		 725 aa  51.2  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 		 833 aa  51.2  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  22.11 
 
 		 844 aa  50.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  29.81 
 
 		 549 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 637 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.06 
 
 		 945 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.89 
 
 		 676 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87186  TPR-repeat containing protein  30.46 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3789  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 425 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 730 aa  50.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.15 
 
 		 991 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  27.08 
 
 		 930 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  24.02 
 
 		 650 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  22.95 
 
 		 999 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1092  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 425 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 809 aa  49.7  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  28.75 
 
 		 316 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 755 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  21.05 
 
 		 788 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1285 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.51 
 
 		 2145 aa  48.5  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3056  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1021 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  24.84 
 
 		 718 aa  48.5  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3508  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 426 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1298 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 824 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43236  predicted protein  23.84 
 
 		 1452 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 872 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.23 
 
 		 810 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  23.53 
 
 		 599 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  21.99 
 
 		 1119 aa  47.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  28.8 
 
 		 992 aa  47.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.61 
 
 		 576 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 265 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  26.13 
 
 		 928 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1162 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  26.24 
 
 		 965 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  25.14 
 
 		 552 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 681 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  33.1 
 
 		 689 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3395  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.81 
 
 		 1169 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 901 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1025 aa  47  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  24.43 
 
 		 1219 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 1162 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0682  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 		 375 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 1050 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.63 
 
 		 1611 aa  45.8  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.37 
 
 		 2327 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 421 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  26.26 
 
 		 293 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.18 
 
 		 809 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  24.39 
 
 		 1826 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>