More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4285 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1204 aa  2342    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  74.81 
 
 
1285 aa  1556    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.67 
 
 
1190 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  40.37 
 
 
1190 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  43.17 
 
 
1226 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.24 
 
 
1160 aa  266  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  31.66 
 
 
1094 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
1142 aa  233  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.42 
 
 
1093 aa  228  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.66 
 
 
1291 aa  221  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.64 
 
 
1081 aa  213  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.45 
 
 
1089 aa  212  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.32 
 
 
1080 aa  206  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.83 
 
 
1141 aa  205  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.39 
 
 
1403 aa  199  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
1050 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.09 
 
 
1050 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.7 
 
 
1055 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.14 
 
 
1198 aa  193  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 
1139 aa  191  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  30.21 
 
 
1063 aa  186  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
1096 aa  186  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.37 
 
 
1149 aa  184  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.5 
 
 
1151 aa  181  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.62 
 
 
1138 aa  180  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
1429 aa  178  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.39 
 
 
1123 aa  177  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.75 
 
 
1148 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 
1151 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  23.93 
 
 
1134 aa  174  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.26 
 
 
1053 aa  173  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.07 
 
 
1014 aa  171  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  28.82 
 
 
1055 aa  170  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.38 
 
 
1271 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1360 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.19 
 
 
1122 aa  162  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.3 
 
 
1441 aa  160  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31 
 
 
1422 aa  151  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 
1046 aa  151  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 
1048 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.41 
 
 
1037 aa  147  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
1298 aa  147  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.34 
 
 
1105 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  22.31 
 
 
1153 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.82 
 
 
1295 aa  138  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.73 
 
 
1117 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
1227 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1130 aa  132  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  38.57 
 
 
518 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.9 
 
 
1175 aa  125  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 
1065 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
1403 aa  123  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.47 
 
 
919 aa  122  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 
320 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 
320 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 
1043 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.96 
 
 
983 aa  115  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 
1071 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.28 
 
 
1264 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.5 
 
 
701 aa  112  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 
515 aa  109  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 
852 aa  108  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 
735 aa  108  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  37.77 
 
 
518 aa  108  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.02 
 
 
1006 aa  107  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
1402 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.95 
 
 
1377 aa  106  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.93 
 
 
805 aa  105  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.06 
 
 
725 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.23 
 
 
665 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  35.75 
 
 
513 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.32 
 
 
611 aa  103  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.24 
 
 
1087 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.55 
 
 
523 aa  102  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  27.88 
 
 
979 aa  101  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.27 
 
 
656 aa  101  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
744 aa  99  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.23 
 
 
657 aa  98.2  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 
1289 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.64 
 
 
1169 aa  98.2  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.76 
 
 
1133 aa  96.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 
746 aa  97.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
479 aa  95.9  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.33 
 
 
614 aa  95.9  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.45 
 
 
658 aa  95.9  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  35.29 
 
 
717 aa  95.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 
1398 aa  95.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 
675 aa  94.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  35.83 
 
 
701 aa  94.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.83 
 
 
694 aa  94  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  36.08 
 
 
971 aa  93.6  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 
758 aa  93.6  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 
681 aa  93.6  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  37.97 
 
 
969 aa  92.8  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  28.6 
 
 
1027 aa  93.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  34.2 
 
 
817 aa  92.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.46 
 
 
879 aa  92.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
1027 aa  92  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
1027 aa  92  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
822 aa  91.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>