More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4346 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  90.25 
 
 
1190 aa  1894    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  47.46 
 
 
1226 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
1190 aa  2281    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  41.38 
 
 
1204 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  41.63 
 
 
1285 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  32.15 
 
 
1094 aa  254  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 
1093 aa  251  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 
1142 aa  250  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.09 
 
 
1081 aa  244  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.32 
 
 
1080 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 
1160 aa  233  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.7 
 
 
1089 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
1148 aa  208  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.49 
 
 
1141 aa  204  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.42 
 
 
1050 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  32.42 
 
 
1050 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
1151 aa  191  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
1139 aa  186  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.59 
 
 
1055 aa  186  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 
1138 aa  184  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 
1151 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.95 
 
 
1403 aa  181  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
1198 aa  181  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.33 
 
 
1053 aa  179  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.77 
 
 
1134 aa  179  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.07 
 
 
1149 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
1063 aa  175  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.09 
 
 
1014 aa  168  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  28.55 
 
 
1123 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.47 
 
 
1429 aa  165  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 
1048 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
1271 aa  157  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.07 
 
 
1441 aa  156  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.75 
 
 
1291 aa  154  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.25 
 
 
1175 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 
1360 aa  147  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
1105 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 
1096 aa  144  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.42 
 
 
1055 aa  141  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
1037 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.77 
 
 
1422 aa  140  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  39.56 
 
 
665 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
1071 aa  131  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.07 
 
 
1087 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.54 
 
 
1046 aa  127  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1403 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  38.62 
 
 
735 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  20.12 
 
 
1153 aa  127  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  37.35 
 
 
320 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  37.35 
 
 
320 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  40.62 
 
 
518 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.79 
 
 
1117 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  41.94 
 
 
725 aa  121  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  38.2 
 
 
513 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30 
 
 
919 aa  120  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  23.85 
 
 
1130 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.25 
 
 
701 aa  116  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.3 
 
 
805 aa  115  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
1027 aa  115  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.81 
 
 
611 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  38.92 
 
 
518 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 
1027 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.96 
 
 
1227 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  37.55 
 
 
1122 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 
1027 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  33.51 
 
 
431 aa  113  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  38.92 
 
 
515 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.51 
 
 
441 aa  111  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.07 
 
 
879 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  28.37 
 
 
979 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 
817 aa  108  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  38.04 
 
 
1020 aa  108  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.45 
 
 
694 aa  108  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
1207 aa  108  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  34.87 
 
 
1065 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  31.73 
 
 
744 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.41 
 
 
815 aa  105  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.43 
 
 
1358 aa  106  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
860 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 
864 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.2 
 
 
717 aa  105  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.5 
 
 
971 aa  104  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 
696 aa  104  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  42.34 
 
 
284 aa  104  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
757 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.04 
 
 
737 aa  103  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.18 
 
 
981 aa  103  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  35.45 
 
 
614 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 
529 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.35 
 
 
1295 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
822 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.87 
 
 
657 aa  103  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 
746 aa  103  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  35 
 
 
487 aa  102  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  34.52 
 
 
645 aa  102  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
861 aa  101  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 
758 aa  101  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.27 
 
 
656 aa  101  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  37.3 
 
 
969 aa  101  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.55 
 
 
672 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>