115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2335 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 		 934 aa  1902    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  29.31 
 
 		 962 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1911 aa  305  2.0000000000000002e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  31.48 
 
 		 982 aa  248  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1621 aa  211  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  32.88 
 
 		 1219 aa  210  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  24.32 
 
 		 1141 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  29.05 
 
 		 724 aa  181  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  28.67 
 
 		 460 aa  168  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1779 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.01 
 
 		 992 aa  151  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1711 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  28.61 
 
 		 599 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  29.08 
 
 		 596 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  24.8 
 
 		 490 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 1083 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 994 aa  140  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 1448 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 1247 aa  132  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1869 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  36.68 
 
 		 552 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 1544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 		 1502 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 1321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  30.55 
 
 		 720 aa  109  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.92 
 
 		 737 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  30.47 
 
 		 393 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  25.78 
 
 		 445 aa  91.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  26.42 
 
 		 720 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 422 aa  88.2  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  27.48 
 
 		 714 aa  84  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 644 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  30.08 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  30.08 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  28.31 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  30.81 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  27.98 
 
 		 326 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  30.14 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  30.14 
 
 		 322 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  29.21 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2800  hypothetical protein  27.19 
 
 		 720 aa  74.3  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000115328 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  22.7 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  31.43 
 
 		 325 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  27.8 
 
 		 325 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  27.22 
 
 		 323 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  27.59 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  26.75 
 
 		 950 aa  64.3  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  29.06 
 
 		 327 aa  63.9  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 418 aa  63.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  23.95 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  27.52 
 
 		 113 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  26.72 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  24.04 
 
 		 476 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  23.97 
 
 		 259 aa  57.4  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 251 aa  57  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  22.22 
 
 		 452 aa  55.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  27.03 
 
 		 412 aa  55.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  29.44 
 
 		 425 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  27.21 
 
 		 451 aa  55.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  26.24 
 
 		 266 aa  54.7  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  26.24 
 
 		 262 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  26.24 
 
 		 267 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1058 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  21.54 
 
 		 1611 aa  54.3  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  18.51 
 
 		 1087 aa  53.5  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1253  hypothetical protein  23.72 
 
 		 458 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.238596  normal  0.0174069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  31.16 
 
 		 501 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  24.5 
 
 		 405 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 945 aa  52.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  27.35 
 
 		 535 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  21.08 
 
 		 478 aa  52.4  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  24.11 
 
 		 298 aa  51.6  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  24.62 
 
 		 298 aa  51.6  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  26.24 
 
 		 423 aa  51.6  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 997 aa  50.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  23.13 
 
 		 1363 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  27.19 
 
 		 426 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  25 
 
 		 276 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  20.71 
 
 		 502 aa  50.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  21.74 
 
 		 454 aa  50.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.55 
 
 		 2145 aa  50.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.25 
 
 		 991 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  23.16 
 
 		 298 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  19.87 
 
 		 216 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  22.3 
 
 		 554 aa  48.9  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  22.78 
 
 		 269 aa  49.3  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  20 
 
 		 907 aa  48.5  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  22.78 
 
 		 269 aa  48.5  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  21.67 
 
 		 416 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  25.48 
 
 		 450 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  22.73 
 
 		 456 aa  48.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1238 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  27.17 
 
 		 249 aa  47.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.79 
 
 		 833 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.35 
 
 		 1288 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 		 828 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  24.85 
 
 		 331 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 730 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  19.49 
 
 		 451 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>