208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1072 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  76.69 
 
 
1082 aa  1634    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
1087 aa  2180    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  39.49 
 
 
1611 aa  379  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
1366 aa  320  1e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
817 aa  196  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 
730 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.26 
 
 
732 aa  144  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  28.19 
 
 
1123 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  25.83 
 
 
1180 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.75 
 
 
2145 aa  127  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.56 
 
 
1238 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.37 
 
 
1550 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.4 
 
 
1914 aa  110  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.63 
 
 
810 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
567 aa  107  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  33.18 
 
 
711 aa  105  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 
878 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
771 aa  94.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 
632 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 
3172 aa  94.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
924 aa  87.4  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
1119 aa  83.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 
448 aa  82.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.62 
 
 
836 aa  79.7  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.53 
 
 
1486 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.68 
 
 
1288 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
454 aa  77.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1674  hypothetical protein  27.27 
 
 
754 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.204775  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
1714 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.72 
 
 
782 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
949 aa  75.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.49 
 
 
1416 aa  75.5  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.78 
 
 
1009 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  22.78 
 
 
338 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
1911 aa  73.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
1105 aa  72  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 
787 aa  70.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
911 aa  70.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.92 
 
 
971 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  28.77 
 
 
310 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.18 
 
 
676 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  19.69 
 
 
887 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0794  tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 
539 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674308  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
649 aa  69.3  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3214  hypothetical protein  27.87 
 
 
691 aa  68.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  19.54 
 
 
1519 aa  68.9  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
444 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  25.61 
 
 
1106 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 
626 aa  67  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  22.31 
 
 
828 aa  65.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  20.48 
 
 
486 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  20.88 
 
 
694 aa  65.1  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
649 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
649 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  24.22 
 
 
714 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  23.78 
 
 
2327 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 
957 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
284 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 
885 aa  63.9  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.37 
 
 
1404 aa  63.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
639 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.71 
 
 
3301 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  20.3 
 
 
681 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  22.51 
 
 
665 aa  62.4  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  21.35 
 
 
740 aa  62.4  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  26.51 
 
 
490 aa  62.4  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
927 aa  62.4  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  17.07 
 
 
1054 aa  62.4  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  20.55 
 
 
733 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
566 aa  62.4  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
852 aa  62  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 
1526 aa  62  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 
767 aa  62  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 
1424 aa  62  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 
637 aa  62  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  20.66 
 
 
909 aa  62  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.72 
 
 
809 aa  61.6  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 
681 aa  61.6  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
4079 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1699  transcriptional regulator  20.54 
 
 
1075 aa  60.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 
577 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.76 
 
 
875 aa  59.7  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.1 
 
 
1212 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
1298 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.83 
 
 
865 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  21.79 
 
 
708 aa  58.2  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
366 aa  58.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
714 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0402  transcriptional regulator, CadC  24.85 
 
 
1124 aa  58.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  21.32 
 
 
1039 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  21 
 
 
847 aa  57.4  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  27.13 
 
 
646 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.81 
 
 
672 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.84 
 
 
620 aa  57  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.26 
 
 
1154 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
2262 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46231  predicted protein  25.31 
 
 
557 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.47 
 
 
2240 aa  56.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
594 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.28 
 
 
1328 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>