48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3801 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 425 aa  844    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  53.22 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  55.05 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  48.37 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  46.93 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  47.1 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  45.64 
 
 		 421 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  43.54 
 
 		 426 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  39.41 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  32.57 
 
 		 322 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  32.57 
 
 		 322 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  31.56 
 
 		 341 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  31.47 
 
 		 325 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  29.17 
 
 		 327 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  31.37 
 
 		 337 aa  96.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  30.24 
 
 		 325 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  32.24 
 
 		 332 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  34.1 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  34.1 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 994 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  29.89 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  28.31 
 
 		 1219 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  32.27 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  24.74 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1911 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  34.09 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  32.08 
 
 		 1141 aa  60.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1779 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1621 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.53 
 
 		 992 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.44 
 
 		 934 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26.9 
 
 		 490 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  31.18 
 
 		 737 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 1502 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1448 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  29.5 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 		 1869 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  36.65 
 
 		 724 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  27.89 
 
 		 982 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  24.1 
 
 		 962 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  26.71 
 
 		 599 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1083 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  27.55 
 
 		 720 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  43.18 
 
 		 596 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 644 aa  47  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  33.92 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 1321 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>