61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0270 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1110    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  39.26 
 
 		 724 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  38.97 
 
 		 596 aa  179  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  37.17 
 
 		 599 aa  174  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  34.17 
 
 		 1141 aa  140  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  34.04 
 
 		 1219 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  30.93 
 
 		 476 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1911 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  32.08 
 
 		 552 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 		 422 aa  94.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 1502 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.33 
 
 		 737 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  31.8 
 
 		 714 aa  87.8  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 994 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  28.48 
 
 		 720 aa  87  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1621 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 1779 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 1711 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  29.3 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.52 
 
 		 644 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 1083 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  21.28 
 
 		 934 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  27.85 
 
 		 982 aa  73.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1448 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  31.7 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  34.35 
 
 		 992 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  29.11 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  32.57 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  28.62 
 
 		 341 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 1544 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  29.91 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  29.91 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  23.36 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  25.23 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  35.21 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 1869 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1253  hypothetical protein  30.11 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.238596  normal  0.0174069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  23.94 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1321 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  27.23 
 
 		 962 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1054 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  27.07 
 
 		 327 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  29.89 
 
 		 326 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  29.89 
 
 		 326 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  27.83 
 
 		 325 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 1247 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  31.22 
 
 		 326 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  31.84 
 
 		 405 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.45 
 
 		 810 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  27.88 
 
 		 325 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  25.21 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  31.65 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  26.48 
 
 		 332 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 421 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 		 1288 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 878 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  29.44 
 
 		 1131 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3172 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  29.06 
 
 		 426 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 632 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>