74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3607 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  802    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  46.19 
 
 		 1621 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  44.36 
 
 		 994 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  43.08 
 
 		 552 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  43.7 
 
 		 1219 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  44.9 
 
 		 1544 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  46.18 
 
 		 1711 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  43.8 
 
 		 1247 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  43.38 
 
 		 1083 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  40.92 
 
 		 1779 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 		 1321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 		 1448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  44.68 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  39.15 
 
 		 992 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 599 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  36.84 
 
 		 724 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  36.36 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  33.48 
 
 		 1141 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  32.07 
 
 		 476 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 1911 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  37.29 
 
 		 737 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  30.47 
 
 		 934 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  31.07 
 
 		 199 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  34.88 
 
 		 714 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  34.95 
 
 		 720 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 1502 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  28.52 
 
 		 982 aa  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  27.68 
 
 		 962 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  29.3 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  36 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.93 
 
 		 644 aa  79  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  36 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  32.43 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  30.52 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  30.52 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  31.17 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  29.92 
 
 		 720 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  32.55 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  31.51 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  31.76 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  30.17 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  32.95 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  25.1 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  34.09 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  29.5 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  28.77 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  29.27 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.95 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 878 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.02 
 
 		 991 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  33.04 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  27.15 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.39 
 
 		 2145 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.43 
 
 		 1694 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.24 
 
 		 833 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  27.78 
 
 		 445 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 649 aa  53.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 602 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  32.34 
 
 		 1288 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 1869 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  28.36 
 
 		 985 aa  50.1  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  34 
 
 		 1131 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 714 aa  49.7  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.03 
 
 		 573 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 718 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 632 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 573 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.37 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.91 
 
 		 733 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.92 
 
 		 828 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2800  hypothetical protein  28.24 
 
 		 720 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000115328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 824 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>