78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2219 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1462    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  39.3 
 
 		 737 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  39.33 
 
 		 720 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  33.14 
 
 		 1219 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  34.73 
 
 		 982 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1502 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1911 aa  111  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  30.5 
 
 		 724 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  27.57 
 
 		 599 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  37.57 
 
 		 552 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 1621 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  29.52 
 
 		 596 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 1779 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  32.91 
 
 		 393 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  35.41 
 
 		 1448 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 1711 aa  90.5  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  26.42 
 
 		 934 aa  90.1  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 994 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  36.97 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  31.73 
 
 		 1141 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 422 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1083 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  29.61 
 
 		 992 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  32.18 
 
 		 341 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1247 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1321 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  30.7 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  29.86 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  29.86 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  32.42 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  32.42 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 1544 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1869 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  28.18 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  28.57 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  25.95 
 
 		 962 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.02 
 
 		 985 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  27.22 
 
 		 445 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  28.65 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  33.54 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.85 
 
 		 1266 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 878 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  32.69 
 
 		 327 aa  57.4  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 1054 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  34.16 
 
 		 325 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  29.19 
 
 		 325 aa  53.9  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 949 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 		 957 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 		 809 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  30.82 
 
 		 501 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.76 
 
 		 991 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.34 
 
 		 755 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 850 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1212 aa  49.7  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1060 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.41 
 
 		 825 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.5 
 
 		 828 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  26.46 
 
 		 714 aa  48.9  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.07 
 
 		 2145 aa  48.9  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  27.72 
 
 		 476 aa  47.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  36.84 
 
 		 405 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.33 
 
 		 493 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 1288 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.34 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 406 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 406 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  25.93 
 
 		 1228 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1261 aa  45.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0448  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 124 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 750 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  25.77 
 
 		 2413 aa  44.3  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1404 aa  44.3  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>