56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1816 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  71.88 
 
 		 322 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  71.88 
 
 		 322 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  59.69 
 
 		 325 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  61.25 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  58.13 
 
 		 327 aa  362  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  51.55 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  52.36 
 
 		 337 aa  299  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  47.66 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  47.78 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  47.78 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  39.41 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  33.49 
 
 		 405 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  36.59 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 421 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 994 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  31.67 
 
 		 426 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 1502 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1621 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  32.55 
 
 		 1219 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  32.02 
 
 		 501 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  31.9 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 1911 aa  82.8  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  36.79 
 
 		 724 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  37.31 
 
 		 599 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  33.02 
 
 		 714 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1711 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  32.84 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  33.91 
 
 		 1141 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.98 
 
 		 934 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1779 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1448 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 1869 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  32.27 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 1083 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  30.7 
 
 		 720 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  30.29 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  28.74 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  29.75 
 
 		 992 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  31.88 
 
 		 737 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.11 
 
 		 644 aa  66.6  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  29.27 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  29.67 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1544 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1247 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 1321 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  29.9 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3871  hypothetical protein  63.89 
 
 		 42 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  35.71 
 
 		 460 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  31.22 
 
 		 560 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 		 991 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  24.62 
 
 		 962 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.19 
 
 		 2413 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  24.24 
 
 		 490 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>