173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3125 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 1141 aa  2238    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  54.05 
 
 		 724 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  55.87 
 
 		 596 aa  376  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  55.9 
 
 		 599 aa  352  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 1621 aa  337  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1911 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 1779 aa  298  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  37.7 
 
 		 1219 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  33.99 
 
 		 1083 aa  218  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 1711 aa  213  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.14 
 
 		 934 aa  209  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1321 aa  200  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1544 aa  194  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  28.09 
 
 		 982 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 1448 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 878 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 994 aa  158  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  36.74 
 
 		 1869 aa  147  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  36.86 
 
 		 714 aa  146  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  28.09 
 
 		 992 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.18 
 
 		 810 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  34.17 
 
 		 560 aa  140  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1247 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  31.88 
 
 		 552 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  20.68 
 
 		 962 aa  133  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  38.04 
 
 		 476 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.32 
 
 		 1694 aa  124  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  30.31 
 
 		 445 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 1119 aa  122  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  39.91 
 
 		 1502 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.43 
 
 		 644 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  33.48 
 
 		 393 aa  112  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25 
 
 		 732 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  30.77 
 
 		 737 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  30.31 
 
 		 720 aa  101  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.32 
 
 		 632 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 		 422 aa  94.7  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  32.26 
 
 		 720 aa  92  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  34.35 
 
 		 326 aa  91.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.54 
 
 		 2145 aa  89.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  24.36 
 
 		 490 aa  89.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 927 aa  85.5  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 		 1363 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.52 
 
 		 799 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1054 aa  79.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  31.58 
 
 		 341 aa  77.4  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  38.27 
 
 		 405 aa  77.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 681 aa  74.7  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  32.29 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  33.83 
 
 		 682 aa  74.3  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 1737 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  23.44 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 714 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  23.43 
 
 		 897 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 		 1288 aa  72.4  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  32.03 
 
 		 326 aa  72  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  32.03 
 
 		 326 aa  72  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  29.24 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 909 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1104 aa  69.7  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.59 
 
 		 1266 aa  68.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  36.77 
 
 		 426 aa  67.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.82 
 
 		 816 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  27.42 
 
 		 1087 aa  66.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  30.81 
 
 		 325 aa  66.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  37.5 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  29.35 
 
 		 327 aa  66.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  38 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.74 
 
 		 626 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 649 aa  64.3  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.5 
 
 		 714 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  27.42 
 
 		 997 aa  63.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  30.22 
 
 		 325 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  37.42 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 		 578 aa  63.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 523 aa  62.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 702 aa  62  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1238 aa  62  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.51 
 
 		 603 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.66 
 
 		 764 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.69 
 
 		 620 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.61 
 
 		 1611 aa  60.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.6 
 
 		 2327 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  25 
 
 		 1123 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 1486 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.89 
 
 		 887 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1550 aa  58.5  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.14 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.15 
 
 		 795 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23 
 
 		 1007 aa  58.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.05 
 
 		 626 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>