40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2368 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  826    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  55.58 
 
 
412 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  52.64 
 
 
416 aa  334  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  49.75 
 
 
421 aa  319  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  43.54 
 
 
425 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  41 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  37.97 
 
 
419 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  37 
 
 
405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  33.51 
 
 
322 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  33.51 
 
 
322 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  36.11 
 
 
326 aa  97.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  36.11 
 
 
326 aa  97.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  31.67 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  30 
 
 
337 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  31.11 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  32.12 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  32.04 
 
 
327 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  29.94 
 
 
325 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 
994 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  28.42 
 
 
325 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  22.83 
 
 
501 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  33.85 
 
 
552 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  29.27 
 
 
393 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  32.31 
 
 
1219 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  36.77 
 
 
1141 aa  56.6  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  31.21 
 
 
599 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  34.23 
 
 
596 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1621 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  28.46 
 
 
992 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  33.82 
 
 
714 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
1779 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
1711 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  30.46 
 
 
724 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.19 
 
 
934 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  29.33 
 
 
445 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
1544 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 
1448 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  29.06 
 
 
560 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
1083 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>