205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0542 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 994 aa  2041    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  42.3 
 
 		 1219 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  41.16 
 
 		 1711 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  39.08 
 
 		 1779 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  51.84 
 
 		 1621 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  40.07 
 
 		 1247 aa  435  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  56.17 
 
 		 1544 aa  429  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  53.25 
 
 		 552 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  54.13 
 
 		 1083 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  51.24 
 
 		 1321 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  44.53 
 
 		 1448 aa  333  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  44.36 
 
 		 393 aa  313  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  32.8 
 
 		 992 aa  241  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  46.57 
 
 		 599 aa  225  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  44.26 
 
 		 724 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.14 
 
 		 1007 aa  220  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  46.87 
 
 		 596 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  54.97 
 
 		 422 aa  205  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1276 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1192 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1276 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 1911 aa  155  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  37.92 
 
 		 1141 aa  151  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  36.97 
 
 		 714 aa  143  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  33.85 
 
 		 934 aa  140  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  30.39 
 
 		 982 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  32.05 
 
 		 476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  30.29 
 
 		 565 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 991 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.35 
 
 		 1266 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1051 aa  122  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  38.52 
 
 		 720 aa  121  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1060 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1502 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  25.07 
 
 		 827 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  29.2 
 
 		 371 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  32.12 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 916 aa  108  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  34.04 
 
 		 737 aa  107  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.92 
 
 		 1694 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  33.98 
 
 		 322 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.62 
 
 		 2741 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  33.98 
 
 		 322 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  34.96 
 
 		 326 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 2741 aa  96.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  24.15 
 
 		 717 aa  97.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  28.47 
 
 		 962 aa  92.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1058 aa  92  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  28.62 
 
 		 490 aa  90.9  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  34.43 
 
 		 341 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  27.31 
 
 		 521 aa  89  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  32.27 
 
 		 445 aa  88.6  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  33.97 
 
 		 327 aa  88.6  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 868 aa  87.8  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  33.07 
 
 		 720 aa  88.2  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  31.6 
 
 		 560 aa  87.4  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  36.42 
 
 		 326 aa  87  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  36.42 
 
 		 326 aa  87  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.24 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 644 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.93 
 
 		 1288 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  30.59 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  31.11 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.2 
 
 		 810 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 949 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 878 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 1162 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.73 
 
 		 532 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 1162 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  23.14 
 
 		 903 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1054 aa  75.5  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 		 1186 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  27.8 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1261 aa  75.1  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  32.6 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.95 
 
 		 1507 aa  74.7  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  34.9 
 
 		 1441 aa  74.7  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 729 aa  74.3  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  32.89 
 
 		 337 aa  74.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  21.54 
 
 		 1247 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 937 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  31.82 
 
 		 425 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  35.1 
 
 		 405 aa  70.1  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  33.79 
 
 		 426 aa  70.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  33.07 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1096 aa  68.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.1 
 
 		 919 aa  68.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 846 aa  67  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  29.6 
 
 		 332 aa  66.6  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.94 
 
 		 968 aa  66.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.19 
 
 		 733 aa  66.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  32.67 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 1025 aa  65.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 851 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  25.81 
 
 		 874 aa  65.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1104 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1142 aa  65.1  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.9 
 
 		 884 aa  64.7  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 854 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>