24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3809 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  803    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  77.19 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  53.22 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  40.85 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  38.35 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  38.4 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  37 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  31.9 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  27.72 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  27.72 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  25.73 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  28.89 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  27.44 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  24.5 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  32.45 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  32.45 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  23.98 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  28.22 
 
 		 737 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  29.69 
 
 		 720 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  24.2 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  23.61 
 
 		 962 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  30.07 
 
 		 1141 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>