56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1254 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  71.88 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  65.31 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  59.69 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  58.07 
 
 		 327 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  53 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  52.53 
 
 		 337 aa  295  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  49.03 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  48.57 
 
 		 326 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  48.57 
 
 		 326 aa  278  9e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  36.14 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  32.57 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  35.59 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 994 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  33.65 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  33.51 
 
 		 426 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 1621 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  30.97 
 
 		 1219 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 1502 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  32.87 
 
 		 714 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 1911 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  30.1 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  31.9 
 
 		 599 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 1448 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1711 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  32.63 
 
 		 724 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 1779 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  30.14 
 
 		 934 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  30.52 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1083 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  33.88 
 
 		 501 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  28.57 
 
 		 1141 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  27.72 
 
 		 405 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  30.51 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  31.43 
 
 		 982 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  31.22 
 
 		 596 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 720 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 1869 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  30.92 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  29.7 
 
 		 992 aa  62.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  29.91 
 
 		 560 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1544 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 1321 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1247 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  26.54 
 
 		 460 aa  57  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  28.39 
 
 		 490 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  25.25 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  28.18 
 
 		 476 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3871  hypothetical protein  69.44 
 
 		 42 aa  53.5  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 		 644 aa  49.3  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  31.15 
 
 		 962 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 991 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 		 718 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>