88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1909 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 490 aa  993    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  33.79 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  25.88 
 
 		 934 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  27.04 
 
 		 962 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1911 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  27.68 
 
 		 982 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  29.69 
 
 		 1219 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  24.54 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  26.96 
 
 		 724 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  22.92 
 
 		 599 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 994 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  28.42 
 
 		 552 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  24.36 
 
 		 1141 aa  90.5  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1621 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1502 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1083 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  31.17 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  25.17 
 
 		 720 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1779 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  32.83 
 
 		 737 aa  70.5  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1448 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  26 
 
 		 714 aa  66.6  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 720 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  22.54 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  25.23 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1711 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1321 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1247 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  28.39 
 
 		 322 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  28.39 
 
 		 322 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1544 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  21.75 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  21.5 
 
 		 352 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1869 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.55 
 
 		 1288 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  28.12 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  26.4 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  29.13 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  24.83 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.91 
 
 		 907 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.15 
 
 		 1131 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  22.79 
 
 		 341 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.52 
 
 		 801 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  27.14 
 
 		 799 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  24.14 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  31.43 
 
 		 950 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  26.09 
 
 		 337 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.9 
 
 		 2145 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  28.24 
 
 		 175 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  24.43 
 
 		 992 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  26.72 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1054 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  26.72 
 
 		 251 aa  47.8  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  26.59 
 
 		 325 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  26.02 
 
 		 501 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.65 
 
 		 636 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  25.2 
 
 		 948 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  28.89 
 
 		 732 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.71 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.62 
 
 		 573 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  23.08 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  24.2 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  26.74 
 
 		 113 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  25.53 
 
 		 591 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  24.07 
 
 		 326 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  24.44 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  24.07 
 
 		 326 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  24.06 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  29.41 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 421 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 833 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  21.53 
 
 		 259 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  24.24 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 706 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  26.35 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 3560 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  28.57 
 
 		 741 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1404 aa  44.3  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  23.53 
 
 		 554 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 589 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 714 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  24.32 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  24.73 
 
 		 229 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  20.35 
 
 		 262 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  30.93 
 
 		 325 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  24.53 
 
 		 450 aa  43.5  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>