123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2334 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 		 460 aa  932    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  33.86 
 
 		 490 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.69 
 
 		 934 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  25.28 
 
 		 962 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 1911 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  28.85 
 
 		 552 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  26.15 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  27.11 
 
 		 1219 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 994 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  23.72 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1621 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  33.66 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  26.73 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  27.78 
 
 		 982 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  22.69 
 
 		 1141 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  29.73 
 
 		 452 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  27.91 
 
 		 950 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  29.73 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.51 
 
 		 907 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  26.14 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  28.15 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  22.66 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  32 
 
 		 113 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  33.02 
 
 		 732 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  28.65 
 
 		 720 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  29.13 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 		 175 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  30.39 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  23.47 
 
 		 560 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1779 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  32.95 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1502 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  26.72 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  31.63 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  22.75 
 
 		 521 aa  63.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  32.41 
 
 		 948 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  33.01 
 
 		 741 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  28.16 
 
 		 720 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  27.38 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  24.27 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.95 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1083 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  25 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  27.86 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  26.98 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.39 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  26.54 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  26.54 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  28.37 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  25.98 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  29.67 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  31.19 
 
 		 267 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  25 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 1711 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 1448 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  27.34 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  26.37 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.82 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  30.39 
 
 		 792 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  30.14 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1321 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  27.85 
 
 		 269 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  28.02 
 
 		 269 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  26.04 
 
 		 143 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  28.09 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  29.25 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  27.55 
 
 		 763 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  25.25 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  28.38 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.57 
 
 		 992 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  26.37 
 
 		 214 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  29.79 
 
 		 554 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  31.51 
 
 		 326 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  25.6 
 
 		 262 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  28.72 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2258  cell wall hydrolase/autolysin  30.43 
 
 		 876 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000147959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  27.66 
 
 		 1176 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  28.28 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  26.83 
 
 		 845 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  26.6 
 
 		 229 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  22.14 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  28.99 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  25.21 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  28.99 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  30.68 
 
 		 249 aa  51.2  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  27.83 
 
 		 325 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  24.24 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 372 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 991 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 541 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  28.26 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.62 
 
 		 644 aa  50.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  24.07 
 
 		 289 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  21.89 
 
 		 714 aa  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  27.27 
 
 		 332 aa  50.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 153 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  26.32 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  26.32 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  25.18 
 
 		 502 aa  48.5  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>