122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0627 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 153 aa  322  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  37.04 
 
 		 320 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  36.91 
 
 		 625 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  47.06 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  34.04 
 
 		 1118 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  36.02 
 
 		 447 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  32.59 
 
 		 754 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  33.09 
 
 		 741 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  35.95 
 
 		 383 aa  97.8  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  39.84 
 
 		 458 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  34.81 
 
 		 421 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  34.81 
 
 		 589 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  33.77 
 
 		 452 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  35.92 
 
 		 474 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  32.85 
 
 		 763 aa  95.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  37.39 
 
 		 652 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  36.29 
 
 		 450 aa  94.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  33.55 
 
 		 329 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  32.39 
 
 		 749 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  34.19 
 
 		 289 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 704 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  34.59 
 
 		 746 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  27.61 
 
 		 781 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  29.73 
 
 		 414 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  43.62 
 
 		 270 aa  84  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  33.6 
 
 		 758 aa  83.6  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  29.75 
 
 		 331 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  33.06 
 
 		 751 aa  80.5  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  28.95 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  34.71 
 
 		 732 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  31.71 
 
 		 549 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 784 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  27.56 
 
 		 429 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.79 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  30 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  34.51 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 		 366 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  34.29 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  35.51 
 
 		 495 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  32.12 
 
 		 487 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  33.11 
 
 		 298 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  29.73 
 
 		 276 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  31.13 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  30.07 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  31.58 
 
 		 332 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  37.76 
 
 		 950 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  33.91 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  32.71 
 
 		 501 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  30.72 
 
 		 450 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  29.41 
 
 		 323 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  28.97 
 
 		 259 aa  67  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.9 
 
 		 431 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  36.04 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  34.62 
 
 		 591 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  33.01 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  30.32 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.08 
 
 		 657 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  31.25 
 
 		 269 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  31.25 
 
 		 269 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.09 
 
 		 907 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  30.58 
 
 		 845 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  27.08 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  26.85 
 
 		 650 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  32.73 
 
 		 478 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  34.86 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  29.82 
 
 		 763 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  29.06 
 
 		 521 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  31.31 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  29.2 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 480 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  26.57 
 
 		 553 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  26.92 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  28.8 
 
 		 784 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  28.57 
 
 		 266 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  28.83 
 
 		 763 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  25.62 
 
 		 291 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 		 547 aa  57  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  28.12 
 
 		 948 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 		 792 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  29.09 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  28.28 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  26.02 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  29.09 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  26.92 
 
 		 418 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 		 541 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  31.73 
 
 		 529 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.63 
 
 		 657 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  27.27 
 
 		 403 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  29.57 
 
 		 535 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  25.15 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  27.63 
 
 		 554 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  23.53 
 
 		 502 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  29.36 
 
 		 304 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  24.11 
 
 		 298 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  26.13 
 
 		 352 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  28.7 
 
 		 1176 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>