55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3364 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  65.31 
 
 
322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  65.31 
 
 
322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  61.25 
 
 
326 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  59.69 
 
 
325 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  55.62 
 
 
327 aa  347  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  50.95 
 
 
341 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  46.47 
 
 
332 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  50.34 
 
 
337 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  30.17 
 
 
405 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4853  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
421 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  30.24 
 
 
425 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  35.29 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  32.78 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
994 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
1502 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  32.02 
 
 
501 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  32.21 
 
 
714 aa  75.9  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  29.96 
 
 
982 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  33.03 
 
 
599 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
1911 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
1621 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  31.91 
 
 
724 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  31.43 
 
 
934 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  30.58 
 
 
1219 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
1448 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  27.08 
 
 
552 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
1779 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
1711 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  30.98 
 
 
1141 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  28.42 
 
 
426 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.021674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  24.5 
 
 
405 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  32.95 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.95 
 
 
737 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.87 
 
 
992 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
1083 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
1544 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  27.85 
 
 
720 aa  56.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0968  hypothetical protein  23.79 
 
 
419 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.364744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
1869 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  34.16 
 
 
720 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
644 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  26.36 
 
 
596 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
1321 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  27.83 
 
 
560 aa  53.1  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
1247 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3871  hypothetical protein  63.89 
 
 
42 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  25 
 
 
962 aa  49.7  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26.59 
 
 
490 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  29.5 
 
 
460 aa  47  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  24.87 
 
 
476 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  28.83 
 
 
445 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>